Горный Алтай и асфальт совместить очень трудно..

Если таки хочется заехать в Горно-Алтайск (хотя, чё там делать?!), то можно после него через Аю двинуть на Алтайское, затем через Белокуриху и Солоновку на Саавушку и Змеиногорск. А оттуда через погранпереход в Михайловке на Шемонаиху.
Если сюда же попадать через настоящий Горный Алтай, типа поехать через Семинский перевал, Туекту, Усть-Кан, то это через Кумир-Коргон будет участок "дороги жизни" - любители асфальта меня точно не поймут.

Воооот....
Ну а Восточный Казахстан, вообще, это для велотуризма просто благодатнейшая земля! Вариантов поехать масса. Можно через Риддер и Большенарымское поехать, а можно вообще через озеро Маркаколь по "австрийской дороге". Правда тут с асфальтом проблемы, бггг. А можно по западному берегу Бухтарминского водохранилища, через Самарское двинуть, тоже по-своему интересно..
Кароч, в любом случае категорически не рекомендую ехать через Восточно-Казахстанскую область по основной автотрассе!! Всё самое интересное там ближе к китайской границе находится.