зазор компенсирует разброс ширины стакана на разных рамах (избегая осевой нагрузки на подшипники) и некоторую свободу настройки чейнлайна.
а ступеньку на пыльнике можно замять при снятии или установке системы -- если она выскочила вместе с валом, это уже нехороший знак.
может быть, умирающий от грязи подшипник тоже убивает её. но имхо всё же важна соосность внешней обоймы и вала.
кстати, если пыльник вылазит, то надо подбирать проставку в зазор именно из какого-либо эластомера, а не жёсткую сплошную. а в идеале волнистую шайбу из нержавейки, наверное.