1 - упаковывать не просили, хотя он и не идеально чистый был, что по правилам - не знаю, но думаю, что каждый перевозчик определяет самостоятельно. Вообще, на "полу" багажника стояли низенькие паллеты. Как раз чтобы обивку не пачкать багажом.
2 - доплатить за вел надо, до Зубцова багажный билет стоит 93 рубля
3 - зависит от автобуса и от съема/несъема переднего колеса. Скажем, на рядом стоящий мострансавтовский влезло бы штуки 4, при снятии колеса переднего и небольшого гемора в виде поочередного засовывания байков. На тот, что был у меня - влезет заметно больше: там, как показалось, байки со снятым колесом и опущенным подседелом можно стоя ставить - тогда и штук 6-8 влезет.
Если едешь один или вдвоем - даже колесо не просят снимать, засовываешь так.