Итак, все сомнения позади. Я его купил!
Мерида Crossway TFS-100 Comfort-V. Размер 46. В кроссовках от промежности до рамы ~ 45 см. (примерно три моих не очень толстых пальца). А теперь, собственно, ответ на мой вопрос, прочитанный в инструкции к велосипеду (цитата):
"Расстояние от верхней трубы рамы до паховой области... д/б не менее 25...50 мм. Для горных велосипедов нормальная величина этого расстояния составляет от 50 до 76 мм."
Помимо приведённых чисто теоретических выкладок ориентировался и на свои ощущения. На раме 48-го размера (Мерида-40) или вышеуказанном Mongoose (размер М) было как-то некомфортно (в т.ч. и важным органам, которые словно ощущали излишнюю близость жёсткого металла). На 46-й же раме - всё нормально. "Органы" почти упираются в раму, если только продвинуться вплотную к рулевой колонке. Проехал от магазина до метро, потом от станции до дома - всё отлично, никакого дискомфорта!